בעבר היה מקובל היה לחלק את סדרת העטלפים לשתי תת סדרות, עטלפי חרקים ועטלפי פירות, אך במחקרים אחרונים נמצאה קרבה מפתיעה בין נציגים משתי תת הסדרות, ובעקבות כך הסיווג המסורתי משתנה. בכל אופן, יש לשים לב כי השמות העבריים עשויים להטעות: פירות וחרקים אינם בהכרח מאפיין מובהק של התפריט. אם כן, כיום עטלפי פירות (Pteropodidae) היא משפחה בסדרת העטלפים (Chiroptera). בארץ מצוי רק מין אחד של עטלף פירות, עטלף פרי מצוי.